Хью Джекман родился 12 октября 1968 года в Сиднее. В семье он был младшим из пятерых детей. Родители — Крис Джекман и Грейс Уотсон — эмигранты из Великобритании. В Австралию они переехали в 60-х годах прошлого столетия. Когда Хью было 8 лет, родители развелись, Грейс вернулась в Англию, а все дети остались с отцом, который вскоре женился во второй раз.
В юности будущий актёр увлекался баскетболом и был капитаном школьной команды.
По окончании школы Хью поступил в технологический университет Сиднея на факультет журналистики. Окончив, получил степень бакалавра в области коммуникаций со специализацией в журналистике. Однако, к концу учёбы он понимает, что профессия журналиста его мало интересует, и увлекается театром.
В 1991 году посещал годичные театральные курсы «The Journey» в Актерском центре в Саррей-Хиллз в Сиднее.