Родился в 1977 году в Розенхайме. Его первой работой стал 12-минутный короткометражный фильм «Добро пожаловать в реальность». Вместе с Аугустом Дилем и Аугустом Цирнером он обеспечил этому фильму очень сильный актерский состав, что способствовало его успеху на многих кинофестивалях. Два года спустя Кройцпайнтнер вместе с Дилем сняли еще один короткий метр «Сотворить дыхание», который был номинирован в 2001 году на немецкую премию юных талантов «Первые шаги».
В 1999 Кройцпайнтнер работал ассистентом по дубляжу над последним фильмом Стенли Кубрика «С широко закрытыми глазами». Два года спустя он снял телевизионный пилот для Jetzt Film под названием «REC-кассетные девочки/кассетные мальчики». Он также был личным ассистентом Эдгара Райтца с 1998 по 2001 год и, таким образом, помогал ему в подготовке съемок заключительной части трилогии «Родина».
В июне 2003 Марко Кройцпайнтнер снял свой полнометражный дебют «Целиком» («Ganz und gar»). А драма о взрослении «Летний шторм» (2004), в которой снялись Роберт Штадлобер и Костя Ульманн, принесла ему ряд наград и уже международную известность.
Талант Кройцпайнтнера был замечен режиссером Роландом Эммерихом, который привлек его на свой проект «Рабство», главные роли в котором исполнили Кевин Кляйн и Алисия Бахледа-Курус. Фильм поднимал проблему детской работорговли между Мексикой и США. Съемки происходили с осени 2005 по зиму 2006 года, а на экраны фильм вышел в 2007 году. В том же году он получил приз Бернхарда Вики на кинофестивале в Мюнхене.Авторы культового сериала "Игра престолов" Дэвид Бениофф и Дэниэл Вайс рассказали о своём новом совместном проекте. Это будет новый сериал, получивший рабочее название "Конфедерат", действие которого развернётся в альтернативной Америке, где всё…
Киностудия 20th Century Fox начала в Сиднее съемки картины "Звездные войны: Эпизод III". Бюджет картины составляет 173 миллиона долларов, участвовать в проекте будут около 1000 человек. Помимо актеров-звезд в картине будут сниматься более 50 австрали