Евгений Голынкин родился 4 июня 1951 года в Ленинграде.
В 1973 году окончил химико-технологический факультет Текстильного института.
В 1981 году окончил Ленинградский институт Театра, музыки и кинематографии по специальности режиссура драмы и телевидения.
В 1990 году окончил Высшие режиссерские курсы по специальности сценарист и режиссер документального кино. Работал на Ленинградской студии документальных фильмов, на Новосибирской студии кинохроники, на Центральной студии научно-популярных фильмов, на Центральной студии документальных фильмов, на телевидении.
С 1993 года директор «Киностудии КЛИО». Призер международных кинофестивалей.